La mitjana de cabal del Ter durant el 2007 a Girona és de 4,20 m³ per segon. Si aquest fos sempre el cabal circulant només compliria el Pla de Cabals –que regula l'aigua mínima que ha de passar pels rius amb criteris ecològics– durant els mesos d'estiu, entre juliol i setembre. Precisament, aquests mesos són els mesos en què el riu va més ple, perquè des dels pantans es deixa anar més aigua per als regants del Baix Ter. Com que es tracta, però, d'un riu mediterrani –que tradicionalment anava ple a la tardor i l'hivern, i sec durant l'estiu–, aquest funcionament altera el mecanisme propi del riu i de la biodiversitat, i és un dels aspectes que han denunciat les entitats ecologistes.

Però si el cabal que circula habitualment pel Ter ja és poc, la sequera de tot l'any passat encara aguditza la situació. La prioritat del govern és el subministrament d'aigua de boca, i les mesures que s'han anat prenent –l'última de les quals, el 9 de gener, tallar el metres cúbics destinats als regants– van en la direcció de reduir l'aigua del riu, amb un cabal mínim per garantir la supervivència dels ecosistemes aquàtics. Tot i això, si la situació no millora, els 700 litres per segon que ara es deixen anar des de Susqueda poden anar disminuint. Amb tot plegat, l'aigua que passa pel Ter entre la Cellera i Salt és en bona part dels afluents que té el riu. A la ciutat de Girona, el pas d'aigua és mínim, perquè la que porta el riu es desvia per la sèquia Monar i la que els sobra va a l'Onyar i el Güell. Així, el Ter no recupera un cert cabal digne fins a Sant Julià de Ramis, gràcies a l'aigua que s'hi retorna de la depuradora de Campdorà i que manté en bona part la vida del riu. Afluents com el Terri també hi ajuden. Aquesta aigua va baixant fins a arribar al Baix Ter, on els regants n'aprofiten una part, i la desembocadura de la gola del Ter, a l'Estartit. Aquests dies, però, la poca aigua que hi passa no té prou força per trencar la sorra de la platja, i el riu no arriba a desembocar.

Des de l'Observatori del Ter es valora que l'ACA hagi fet públiques les dades de cabals, una de les seves peticions constants.